O programa de pós-graduação do departamento foi recentemente re-estruturado, não só para acompanhar a evolução que vem ocorrendo na área de conhecimento como também para se adequar à reestruturação departamental que criou o Departamento de Cirurgia e Anatomia. A reestruturação incluiu, na área de concentração em Clínica Cirúrgica, a criação de duas opções distintas: Cirurgia e Morfologia e Medicina Experimental.